In het jaar dat de club 125 bestaat sleept Vitesse de eerste hoofdprijs binnen in haar bestaan. In een weinig verheffende finale tegen AZ beslist Ricky van Wolfswinkel in de laatste tien minuten het duel. Op weg naar de finale schakelt Vitesse onder meer Feyenoord uit. De topclubs liggen er allemaal al vroeg uit. PSV verliest al in de 2e ronde van Sparta Rotterdam en Ajax laat zich verrassen door Cambuur.
De Friezen zijn dé verrassing van het toernooi en schakelen ook FC Utrecht op eigen veld uit. In de halve finale buigt het pas na strafschoppen voor AZ. Jodan Boys zorgt echter voor de grootste verrassing door Go Ahead Eagles uit te schakelen. De winst van de club uit Gouda is cijfermatig de grootste stunt ooit. Nooit eerder won een club van het vijfde niveau van een club uit de Eredivisie en al helemaal niet in eigen stadion.
| 1e voorronde | ||||||
| 16/08/2016 | Staphorst (V) | AZSV (V) | 1-2 | 300 | Annegarn | 1-0 Koster, 1-1 Bouwmeister, 1-2 Van der Eerden |
| 17/08/2016 | Quick (V) | Oranje Wit (VI) | 2-0 | 200 | Kampman | 1-0 en 2-0 Boshoff |
| 17/08/2016 | WV-HEDW (VII) | Quick'20 (IV) | 0-3 | 102 | Winkel | 0-1 Snelders, 0-2 en 0-3 Van Benthem |
| 17/08/2016 | OJC Rosmalen (IV) | Oranje Nassau (V) | 3-0 | 250 | Vreekamp | 1-0 (e.d), 2-0 en 3-0 Chraou |
| 17/08/2016 | Noordwijk (V) | UDI'19 (IV) ** | 4-5 | 300 | Puts | 0-1 Koot, 1-1 Lomis, 1-2 Van Geelkerken, 2-2 Wendt, 2-3 Koot, 3-3 Boukhari (pen), 3-4 Wassenberg, 3-5 Koot, 4-5 Spil; R: Dorothea |
| 17/08/2016 | Avanti'31 (VIII) | SVZW (VI) | 0-2 | 400 | Nagtegaal | 0-1 Andrzejak, 0-2 Aman |
| 17/08/2016 | Groene Ster (V) | FC Rijnvogels (IV) ** | 0-2 | 250 | Bijl | 0-1 Van der Stoep, 0-2 Van Veen; R: Maessen (Gro) |
| 17/08/2016 | OFC (IV) | Flevo Boys (V) | 2-1 | 200 | Te Kloeze | 1-0 Van der Leuv, 2-0 El Yacoubi, 2-1 Bakker |
| 17/08/2016 | RKZVC (VII) | Achilles Veen (V) | 0-4 | 300 | Vd Pol | 0-1 Aerts, 0-2 Reniers, 0-3 Andjole, 0-4 Aerts |
| 17/08/2016 | AFC'34 (VI) | Bennekom (VI) | 4-1 | 100 | Cantineau | 1-0 Kansen (pen), 2-0 en 3-0 Kobina Plange, 4-0 Kansen (pen), 4-1 Rekmans; R: Beuker (Ben) |
| 17/08/2016 | Velsen (VI) | Groningen (VII) | 0-1 | 300 | Vd Elzen | 0-1 Oppewal |
| 17/08/2016 | ASWH (IV) | Chevremont (V) | 2-1 | 300 | Ruperti | 1-0 Slotboom, 1-1 Arets, 2-1 De Lange |
| 17/08/2016 | FC Lisse (IV) | De Dijk (IV) | 1-3 | 350 | Teuben | 0-1 Ahahaoui, 1-1 Fokkema, 1-2 Kaars, 1-3 El Gourari (pen) |
| 17/08/2016 | Be Quick 1887 (IV) | RVVH (V) | 0-2 | 225 | 0-1 Bonevacia, 0-2 De Jesus | |
| 17/08/2016 | VVOG (IV) | Halsteren (V) *** | 1-1 | 400 | Dröge | 1-0 Braam, 1-1 Amoah |
| 17/08/2016 | Schaesberg (VI) ** | Kloetinge (VI) | 3-1 | 175 | De Vries | 1-0 Latten, 1-1 Mulder, 2-1 Maassen, 3-1 Benders (p) |
| 17/08/2016 | Stedoco (IV) | Huizen (IV) | 0-2 | 300 | Vd Laan | 0-1 De Graaf, 0-2 Van Loen |
| 17/08/2016 | Jodan Boys (V) *** | Swift (V) | 1-1 | 200 | Smit | 1-0 Akanoui, 1-1 Ruijter |
| 2e voorronde | ||||||
| 24/08/2016 | DVS'33 Ermelo (IV) | AZSV (V) | 4-2 | 350 | Kampman | 1-0 Sahbaz, 1-1 Van der Eerden, 2-1 De Ruiter, 2-2 Bouwmeister, 3-2 Sahbaz, 4-2 Epe |
| 24/08/2016 | VVSB (III) | Hercules (IV) | 2-0 | 450 | Teuben | 1-0 Parami, 2-0 Serbony |
| 24/08/2016 | Dongen (IV) | OFC (IV) | 2-1 | 450 | Vd Elzen | 0-1 Aanzi, 1-1 Hultermans, 2-1 Van der Waarden |
| 24/08/2016 | AFC (III) | Kozakken Boys (III) | 1-5 | 400 | Puts | 0-1 Pires Tavares, 0-2 Mendes Moreira, 0-3 Powel, 1-3 Kluin, 1-4 Powel, 1-5 Pires Tavares (pen) |
| 24/08/2016 | OJC Rosmalen (IV) | Groningen (VII) | 5-1 | 250 | Annegarn | 1-0 Lokasi, 2-0 Alakmak, 3-0 Chraou, 4-0 Van der Ven, 5-0 Chraou, 5-1 Walstra |
| 24/08/2016 | Quick'20 (IV) | JVC Cuijk (IV) | 1-3 | 300 | Winkel | 0-1 Maria, 1-1 Oude Lashof, 1-2 Zaimi (pen), 1-3 Maria |
| 23/08/2016 | Quick Boys (IV) | IJsselmeervogels (IV) | 0-2 | 1.834 | Bronsvoort | 0-1 De Harder, 0-2 Burgerhout |
| 24/08/2016 | ONS Sneek (IV) | De Dijk (IV) | 1-2 | 250 | Dröge | 0-1 Kaars, 1-1 Stevens, 1-2 Menzo |
| 24/08/2016 | Magreb'90 (IV) | Harkemase B. (IV) *** | 5-5 | 350 | Cantineau | 1-0 Cibrani, 1-1 Hardijk, 2-1 Demirci, 2-2 Bouius, 3-2 Te Vrede, 3-3 Musliu, 3-4 Schokker, 3-5 Uuldriks, 4-5 Sansey, 5-5 Bellahsan |
| 24/08/2016 | Scheveningen (IV) | GVVV (III) | 5-2 | 300 | Ruperti | 0-1 Tervoert, 1-1 Nieuwlaat, 2-1 Barradas (p), 3-1 De Vlugt, 4-1 Jungschläger, 5-1 Barradas, 5-2 Mulder |
| 24/08/2016 | RVVH (V) | ASWH (IV) | 0-2 | 700 | Vd Pol | 0-1 (pen) en 0-2 Olijfveld |
| 24/08/2016 | AFC'34 (VI) | FC Rijnvogels (IV) | 2-6 | 150 | Smit | 1-0 Schuffelen, 2-0 Dihalu, 2-1 Dijkstra, 2-2 Vd Stoep, 2-3 en 2-4 Kaya, 2-5 en 2-6 Van Duijn |
| 24/08/2016 | HBS (IV) | Achilles Veen (V) | 2-3 | 400 | Gansner | 0-1 Van Zaanen, 1-1 Hulst, 2-1 Aoulad Said, 2-2 Kuijpers, 2-3 Van Zaanen (pen) |
| 24/08/2016 | Barendrecht (III) | Juliana'31 (IV) | 3-1 | 150 | Selier | 1-0 Eekman (pen), 2-0 Winterberg, 3-0 Salem, 3-1 Meijers (pen) |
| 24/08/2016 | Quick (V) | EVV (IV) ** | 0-1 | 250 | De Brito | 0-1 Lemmens (pen) |
| 24/08/2016 | Halsteren (V) | Capelle (IV) | 0-3 | 250 | Bijl | 0-1 en 0-2 Van der Steen, 0-3 Fens |
| 24/08/2016 | Schaesberg (VI) | HSC'21 (IV) | 2-3 | 200 | 0-1 Ottink, 0-2 Screever, 1-2 D. Latten, 1-3 B. ter Hogt, 2-3 D. Latten (pen) |
|
| 24/08/2016 | UDI'19 (IV) | Rijnsburgse Boys (IV) | 0-1 | 350 | Vd Laan | 0-1 El Yaakoubi |
| 24/08/2016 | Huizen (IV) *** | Westlandia (IV) | 3-3 | 200 | Veekamp | 1-0 Van Loen, 2-0 Eijkemans, 2-1 Spruijt, 2-2 Ripson, 3-2 de Graaf, 3-3 Spruijt; R: De Jong (Wes) |
| 24/08/2016 | Jodan Boys (V) | SVZW (VI) | 3-0 | 450 | Vries | 1-0 Brank, 2-0 Waandels, 3-0 Pattinama |
| 24/08/2016 | UNA (III) | ODIN'59 (IV) | 3-2 | 400 | Nagtegaal | 1-0 N. van Boekel, 2-0 Van de Gevel, 2-1 Cremers, 3-1 Van de Gevel, 3-2 Klijbroek |
| 1e ronde | ||||||
| 20/09/2016 | Barendrecht (III) | Excelsior | 0-1 | 1.225 | Vd Kerkhof | 0-1 Hasselbaink |
| 20/09/2016 | Capelle (IV) | FC Groningen | 0-4 | 1.500 | Blank | 0-1 Hoesen, 0-2 Hateboer, 0-3 Van Weert, 0-4 Sørloth |
| 20/09/2016 | FC Den Bosch (II) | FC Eindhoven (II) | 2-3 | 1.500 | Blom | 0-1 Lieder, 1-1 Havar, 1-2 Lieder, 2-2 Bilate, 2-3 Vloet |
| 20/09/2016 | EVV (IV) ** | RKC Waalwijk (II) | 0-3 | 600 | Oostrom | 0-1 Benson, 0-2 Langedijk, 0-3 Greene |
| 20/09/2016 | HHC Hardenberg (III) | Jodan Boys (V) *** | 2-2 | 800 | Teuben | 1-0 Van der Ley, 1-1 Waandels, 1-2 Akanioui, 2-2 Piljic |
| 20/09/2016 | sc Heerenveen ** | De Graafschap (II) | 5-1 | 11.150 | Bax | 0-1 Van Overbeek, 1-1 en 2-1 Veerman, 3-1 Zeneli, 4-1 Namli, 5-1 Schaars |
| 20/09/2016 | JVC Cuijk (IV) | Telstar | 1-3 | 400 | C. Mulder | 0-1 Ajnane, 0-2 Mahmudov, 1-2 Ritzen, 1-3 Abdulahi |
| 20/09/2016 | Kozakken Boys (III) | Helmond Sport (II) | 3-0 | 1.500 | Nijhuis | 1-0 Ignacio, 2-0 Stout, 3-0 Pires Tavares |
| 20/09/2016 | IJsselmeervogels (IV) | Achilles'29 (II) | 3-1 | 1.200 | Vd Graaf | 1-0 Grot, 2-0 Akla, 3-0 Van Hussen, 3-1 Boogers |
| 20/09/2016 | NAC Breda (II) | VVV-Venlo (II) | 0-2 | 5.734 | KAmphuis | 0-1 en 0-2 Hunte |
| 20/09/2016 | Rijnsburgse Boys (IV) | Almere City FC (II) | 0-2 | 600 | Vd Eijk | 0-1 en 0-2 Arica |
| 20/09/2016 | FC Rijnvogels (IV) | SC Cambuur (II) | 0-1 | 550 | Dieperink | 0-1 Barto |
| 20/09/2016 | Scheveningen (IV) | FC Emmen (II) | 1-2 | 355 | Gerrets | 1-0 Tim Peters, 1-1 Cas Peters, 1-2 Krohne |
| 20/09/2016 | FC Volendam (II) *** | MVV Maastricht (II) | 3-3 | 1.094 | Kooij | 0-1 Pedro, 0-2 Verheijdt, 1-2 Tuyp,1-3 Schroyen, 2-3 en 3-3 Tuyp |
| 21/09/2016 | Dongen (IV) | Go Ahead Eagles | 1-3 | 1.500 | Berben | 1-0 Mijnhijmer, 1-1 Schenk, 1-2 Teijsse, 1-3 Hendriks |
| 21/09/2016 | PSV | Roda JC | 4-0 | 30.000 | Liesveld | 1-0 Pröpper, 2-0 Pereiro, 3-0 Pröpper, 4-0 Narsingh |
| 21/09/2016 | Achilles Veen (V) | VVSB (III) | 1-4 | 700 | Janssen | 0-1 Parami, 0-2 Jozic, 0-3 Serbony, 0-4 Seghrouchni, 1-4 Sülün (pen) |
| 21/09/2016 | Excelsior Maassluis (III) | Heracles Almelo ** | 1-3 | 750 | Vd Vrande | 0-1 Vermeij, 1-1 Smith, 1-2 Vermeij, 1-3 Kuwas |
| 21/09/2016 | NEC | ADO Den Haag *** | 1-1 | 4.005 | S. Mulder | 1-0 Breinburg (pen), 1-1 Kastaneer |
| 21/09/2016 | UNA (III) | Huizen (IV) | 1-0 | 400 | Bijl | 1-0 Van de Gevel |
| 21/09/2016 | De Treffers (III) | ASWH (IV) | 0-3 | 615 | Van Herk | 0-1 De Lange, 0-2 Verhoeven, 0-3 Deprez |
| 21/09/2016 | Spakenburg (III) | Fortuna Sittard (II) | 2-1 | 1.500 | Martens | 1-0 Pilon, 2-0 Van den Meiracker, 2-1 Khalouta R: Braun (For) |
| 21/09/2016 | Koninklijke HFC (III) | OJC Rosmalen (IV) | 6-1 | 350 | Dröge | 1-0 Derguti, 2-0 Van Soest, 3-0 Wilffert, 3-1 Van Mosselveld, 4-1 Van Soest, 5-1 Sam Sin (pen), 6-1 Postma |
| 21/09/2016 | DVS'33 Ermelo (IV) | PEC Zwolle | 1-4 | 2.500 | Lindhout | 0-1 Brock-Madsen, 0-2 Van Polen (pen), 0-3 Achahbar, 0-4 Brock-Madsen, 1-4 Velda |
| 21/09/2016 | Sparta Rotterdam | FC Dordrecht (II) | 3-1 | 5.823 | Wiedemeijer | 1-0 Dijkstra, 2-0 Verhaar, 3-0 Kramer (e.d.), 3-1 Daniels; R: Verhaar (Spa) |
| 21/09/2016 | FC Lienden (III) | AZ | 1-4 | 1.200 | Higler | 0-1 Tankovic, 1-1 Bendadi, 1-2 en 1-3 Bel Hassani, 1-4 Mühren |
| 21/09/2016 | Katwijk (III) | Harkemase B. (IV) | 2-1 | 800 | Ruperti | 0-1 Adams, 1-1 Susan, 2-1 Van den Ban |
| 21/09/2016 | Ajax | Willem II | 5-0 | 33.250 | Makkelie | 1-0 Bazoer, 2-0 De Ligt, 3-0 Ziyech, 4-0 Schöne, 5-0 Nouri; R: Kali (Wil) |
| 22/09/2016 | De Dijk (IV) | Vitesse | 2-7 | 1.200 | Blom | 0-1 Baker, 0-2 Leerdam, 1-2 Zwarthoed, 1-3 Van Wolfswinkel (pen), 1-4 en 1-5 Tighadouini, 2-5 Kaars, 2-6 Rashica, 2-7 Koryan |
| 22/09/2016 | HSC'21 (IV) | TEC (III) | 1-5 | 500 | Manschot | 0-1 Peltzer, 0-2 en 0-3 Vink, 0-4 Bartels, 0-5 Huijgens, 1-5 Cenk Uguz |
| 22/09/2016 | Feyenoord | FC Oss (II) | 4-1 | 47.000 | Van Boekel | 0-1 Boere, 1-1 Berghuis, 2-1 Kramer, 3-1 Basaçikoglu, 4-1 Jørgensen |
| 22/09/2016 | FC Twente | FC Utrecht | 1-3 | 22.200 | Gözübüyük | 0-1 Zivkovic, 1-1 Ünal, 1-2 Haller, 1-3 Zivkovic |
| 2e ronde | ||||||
| 25/10/2016 | ADO Den Haag | Telstar | 2-1 | 5.106 | Liesveld | 0-1 Mahmudov, 1-1 Havenaar, 2-1 Van der Heijden |
| 25/10/2016 | Go Ahead Eagles | Jodan Boys (V) | 1-2 | 5.163 | Perez | 1-0 Hendriks, 1-1 Marengo, 1-2 Heerkens |
| 25/10/2016 | Spakenburg (III) | ASWH (IV) ** | 2-3 | 1.500 | Blank | 0-1 Olijfveld, 0-2 De Lange, 1-2 Pilon, 2-2 Van den Meiracker, 2-3 Verhoeve |
| 25/10/2016 | Sparta Rotterdam | PSV | 3-1 | 10.525 | Makkelie | 1-0 Vriends, 1-1 Ramselaar, 2-1 El Azzouzi, 3-1 Brogno |
| 25/10/2016 | TEC (III) | SC Cambuur (II) | 0-4 | 1.100 | Vd Eijk | 0-1 Monteiro, 0-2 en 0-3 Van Deelen, 0-4 Monteiro |
| 25/10/2016 | FC Volendam (II) ** | Almere City FC (II) | 2-1 | 1.660 | Vd Graaf | 0-1 Ramsteijn, 1-1 Kwakman, 2-1 Steltenpool |
| 25/10/2016 | VVSB (III) | Katwijk (III) | 3-0 | 2.500 | Lindhout | 1-0 Parami, 2-0 De Rijk, 3-0 Serbony |
| 26/10/2016 | AZ | FC Emmen (II) | 1-0 | Bax | 1-0 Mühren | |
| 26/10/2016 | Feyenoord | Excelsior | 4-0 | 37.000 | Blom | 1-0 Elia, 2-0 Botteghin, 3-0 Toornstra, 4-0 Vejinovic |
| 26/10/2016 | Heracles Almelo | UNA (III) | 5-0 | 7.922 | Dieperink | 1-0 en 2-0 Armenteros, 3-0 Kuwas, 4-0 Pelupessy, 5-0 Darri |
| 26/10/2016 | IJsselmeervogels (IV) | Koninklijke HFC (III) | 3-1 | 1.250 | Berben | 1-0 Grot, 2-0 Akla, 2-1 Noordmans, 3-1 Grot (pen) |
| 26/10/2016 | Kozakken Boys (III) | Ajax | 1-6 | 4.000 | Manschot | 0-1 Cassierra, 0-2 El Ghazi, 0-3 Cassierra, 0-4 Cerny, 0-5 Clement, 1-5 Ignacio, 1-6 Clement |
| 26/10/2016 | FC Utrecht | FC Groningen | 1-0 | 16.377 | Gözübüyük | 1-0 Barazite |
| 26/10/2016 | Vitesse | RKC Waalwijk (II) | 4-1 | Higler | 1-0 Zhang, 1-1 Langedijk, 2-1 Baker (pen), 3-1 Nakamba, 4-1 Nathan |
|
| 27/10/2016 | FC Eindhoven (II) | sc Heerenveen | 1-2 | Vd Kerkhof | 0-1 Namli, 0-2 Ghoochannejhad, 1-2 Caenepeel | |
| 27/10/2016 | PEC Zwolle | VVV-Venlo (II) | 2-1 | 12.275 | Kamphuis | 1-0 Ehizibue, 2-0 Mokhtar, 2-1 Sleegers |
| 3e ronde | ||||||
| 13/12/2016 | IJsselmeervogels (IV) | sc Heerenveen | 0-1 | 4.750 | Bax | 0-1 Ghoochannejhad |
| 13/12/2016 | FC Volendam (II) | VVSB (III) | 4-1 | 3.988 | Van Boekel | 1-0 Schouten, 1-1 Serbony, 2-1 Kwakman, 3-1 Van Velzen, 4-1 Van Kippersluis |
| 14/12/2016 | AZ | ASWH (IV) | 2-0 | 4.600 | S. Mulder | 1-0 Mühren, 2-0 Friday |
| 14/12/2016 | Feyenoord | ADO Den Haag | 5-1 | 32.500 | Janssen | 1-0 Jørgensen, 2-0 (pen) en 3-0 Kuyt, 4-0 El Ahmadi, 5-0 Kuyt (pen), 5-1 Kastaneer |
| 14/12/2016 | PEC Zwolle | FC Utrecht | 0-1 | 7.600 | Kuipers | 1-0 Brock-Madsen, 1-1 Conboy, 1-2 Zivkovic |
| 14/12/2016 | Vitesse | Jodan Boys (V) *** | 4-0 | 7.257 | Vd Graaf | 1-0 Miazga, 2-0 Tighadouini, 3-0 Baker (pen), 4-0 Rashica; R: Marengo (Jod) |
| 15/12/2016 | SC Cambuur (II) | Ajax | 2-1 | 9.203 | Blom | 1-0 en 2-0 Barto, 2-1 Clement |
| 15/12/2016 | Heracles Almelo | Sparta Rotterdam | 0-3 | 6.112 | Gözübüyük | 0-1, 0-2 en 0-3 El Azzouzi; R: Duarte (Her) |
| Kwartfinale | ||||||
| 24/01/2017 | FC Volendam (II) | Sparta Rotterdam *** | 1-1 | 3.469 | Kamphuis | 0-1 Verhaar, 1-1 Steltenpool |
| 25/01/2017 | AZ | sc Heerenveen | 1-0 | 8.276 | Kuipers | 1-0 Luckassen |
| 25/01/2017 | FC Utrecht | SC Cambuur (II) *** | 2-2 | 13.997 | Van Boekel | 1-0 Leeuwiin, 1-1 Bakker (pen), 1-2 Barto, 2-2 Troupee |
| 26/01/2017 | Vitesse | Feyenoord | 2-0 | 15.673 | Makkelie | 1-0 Kashia, 2-0 Tighadouini |
| Halve finale | ||||||
| 01/03/2017 | Sparta Rotterdam | Vitesse | 1-2 | 10.349 | Van Boekel | 0-1 en 0-2 Baker, 1-2 Kashia (e.d.) |
| 02/03/2017 | AZ *** | SC Cambuur (II) | 0-0 | 14.239 | Blom | R: Van Eijden (AZ) |
| Finale | ||||||
| 30/04/2017 | AZ | Vitesse | 0-2 | 46.105 | Makkelie | 0-1 en 0-2 Van Wolfswinkel Gespeeld in Rotterdam (Stadion Feijenoord) |